rows { options { physical_type: PHYSICAL_STREAM_TYPE_QUADS max_name_table_size: 128 max_prefix_table_size: 16 max_datatype_table_size: 16 logical_type: LOGICAL_STREAM_TYPE_DATASETS version: 2 } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/" } } rows { name { value: "RAMVUimnATifJYJw0VP2zAesw4OK_Gw30p9NgcEU4oVW8" } } rows { namespace { name: "this" value { prefix_id: 1 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/RAMVUimnATifJYJw0VP2zAesw4OK_Gw30p9NgcEU4oVW8/" } } rows { name { } } rows { namespace { name: "sub" value { prefix_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://schema.org/" } } rows { namespace { name: "schema" value { prefix_id: 3 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.nanopub.org/nschema#" } } rows { namespace { name: "np" value { prefix_id: 4 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://edamontology.org/" } } rows { namespace { name: "edam" value { prefix_id: 5 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/pav/" } } rows { namespace { name: "pav" value { prefix_id: 6 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" } } rows { namespace { name: "xsd" value { prefix_id: 7 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/o/ntemplate/" } } rows { namespace { name: "ntemplate" value { prefix_id: 8 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#" } } rows { namespace { name: "rdfs" value { prefix_id: 9 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://orcid.org/" } } rows { namespace { name: "orcid" value { prefix_id: 10 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/dc/terms/" } } rows { namespace { name: "dct" value { prefix_id: 11 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/nanopub/x/" } } rows { namespace { name: "npx" value { prefix_id: 12 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/ontology/bibo/" } } rows { namespace { name: "bibo" value { prefix_id: 13 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/ns/prov#" } } rows { namespace { name: "prov" value { prefix_id: 14 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://xmlns.com/foaf/0.1/" } } rows { namespace { name: "foaf" value { prefix_id: 15 name_id: 2 } } } rows { name { value: "hasAssertion" } } rows { name { value: "assertion" } } rows { name { value: "Head" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 4 name_id: 3 } o_iri { prefix_id: 2 } g_iri { } } } rows { name { value: "hasProvenance" } } rows { name { value: "provenance" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 } o_iri { prefix_id: 2 } } } rows { name { value: "hasPublicationInfo" } } rows { name { value: "pubinfo" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 } o_iri { prefix_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" } } rows { name { value: "type" } } rows { name { value: "Nanopublication" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 } o_iri { prefix_id: 4 } } } rows { prefix { id: 3 value: "http://purl.org/coloc-seq/" } } rows { name { value: "method" } } rows { name { value: "has_function" } } rows { name { value: "operation_3680" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 3 } p_iri { prefix_id: 5 } o_iri { } g_iri { prefix_id: 2 name_id: 4 } } } rows { prefix { id: 6 value: "http://schema.org/" } } rows { name { value: "applicationArea" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 15 } o_literal { lex: "Extracellular vesicle characterization" langtag: "en" } } } rows { quad { o_literal { lex: "Mitochondrial transcriptomics" langtag: "en" } } } rows { quad { o_literal { lex: "Organelle RNA localisation" langtag: "en" } } } rows { name { value: "description" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "Controlled Level of Contamination coupled to deep sequencing - a novel subcellular transcriptomics approach" langtag: "en" } } } rows { name { value: "name" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "CoLoC-seq" langtag: "en" } } } rows { name { value: "data_0957" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 18 } } } rows { name { value: "Thing" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 6 } } } rows { name { value: "comment" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 9 } o_literal { lex: "Leverages classical enzymatic kinetics to track depletion dynamics of transcripts using RNase gradients" langtag: "en" } } } rows { name { value: "about" } } rows { prefix { value: "https://doi.org/10.1093/nar/" } } rows { name { value: "gkac1205" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 6 name_id: 21 } o_iri { prefix_id: 7 } } } rows { name { value: "text" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 } o_literal { lex: "CoLoC-seq is a novel subcellular transcriptomics approach that uses enzymatic kinetics to distinguish genuine organellar resident RNAs from surface-attached contaminants." langtag: "en" } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/RAMVUimnATifJYJw0VP2zAesw4OK_Gw30p9NgcEU4oVW8/o/ntemplate/" } } rows { name { value: "AIDA-Sentence" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 8 name_id: 24 } } } rows { name { value: "seeAlso" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 9 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 14 } } } rows { name { value: "doi" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 7 name_id: 22 } p_iri { prefix_id: 13 name_id: 26 } o_literal { lex: "10.1093/nar/gkac1205" } g_iri { prefix_id: 2 name_id: 7 } } } rows { name { value: "datePublished" } } rows { datatype { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#gYear" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 27 } o_literal { lex: "2023" datatype: 1 } } } rows { name { value: "isPartOf" } } rows { name { value: "__1" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 2 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 17 } o_literal { lex: "CoLoC-seq probes the global topology of organelle transcriptomes" langtag: "en" } } } rows { name { value: "AcademicArticle" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 13 name_id: 30 } } } rows { name { value: "ScholarlyArticle" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 6 } } } rows { name { value: "issn" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 2 name_id: 29 } p_iri { prefix_id: 6 name_id: 32 } o_literal { lex: "0305-1048" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 17 } o_literal { lex: "Nucleic Acids Research" langtag: "en" } } } rows { name { value: "Periodical" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 6 name_id: 33 } } } rows { name { value: "wasAttributedTo" } } rows { name { value: "0000-0001-8763-6703" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 2 name_id: 4 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 34 } o_iri { prefix_id: 10 } } } rows { name { value: "0000-0002-1481-2996" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "0000-0002-9142-7979" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "wasDerivedFrom" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 22 } } } rows { name { value: "0009-0005-7752-8203" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 name_id: 39 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 17 } o_literal { lex: "Tiado Kollender" } g_iri { prefix_id: 2 name_id: 9 } } } rows { name { value: "created" } } rows { datatype { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 11 name_id: 40 } o_literal { lex: "2026-01-11T00:00:00Z" datatype: 2 } } } rows { name { value: "license" } } rows { prefix { id: 12 value: "https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 12 name_id: 2 } } } rows { prefix { id: 4 value: "http://purl.org/nanopub/x/" } } rows { name { value: "signedBy" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 name_id: 42 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 39 } } } rows { name { value: "wasCreatedFromPubinfoTemplate" } } rows { name { value: "RA0J4vUn_dekg-U1kK3AOEt02p9mT2WO03uGxLDec1jLw" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 name_id: 43 } o_iri { prefix_id: 1 } } } rows { name { value: "RAukAcWHRDlkqxk7H2XNSegc1WnHI569INvNr-xdptDGI" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { prefix { id: 3 value: "http://purl.org/pav/" } } rows { name { value: "createdBy" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 3 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 39 } } } rows { name { value: "ExampleNanopub" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 47 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 9 name_id: 20 } o_literal { lex: "AIDA-based assertion defining CoLoC-seq as a novel subcellular transcriptomics approach" langtag: "en" } } } rows { name { value: "label" } } rows { quad { p_iri { name_id: 48 } o_literal { lex: "Nanopublication: CoLoC-seq core method definition" langtag: "en" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 34 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 39 } } } rows { name { value: "sig" } } rows { name { value: "hasAlgorithm" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 2 name_id: 49 } p_iri { prefix_id: 4 } o_literal { lex: "RSA" } } } rows { name { value: "hasPublicKey" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "MIIBIjANBgkqhkiG9w0BAQEFAAOCAQ8AMIIBCgKCAQEAoSR/rqhnkTPQO8u4l2JQAemJo5cN83rT54nA5NXHUqaeu26bEjT/rsX1PCVBhhJ3cV2uu4wjI0NfcVaKPKmODSf6p579tdOykOnjbWLbxxPMe5DC5eV1ThMHsFsNU/6vCYIfS00E7wre7fnFYz7FAG7v1MZEyWeSXsHgk9jHoqQQDPqup5PHReKp1dd6J0Nht/OfSYnUancKAgIFyPhkTlThsLK5xSNyNEgiTR7pwkP5pGq2AnD6bPw4G3kiPnIpIGZNsaeIOvhn64gwbrtoJVdoun/namw6FQ7StEC5km/0evaBZc4qIextwO/s32Wru77ukblJ0Xi/YzbC0iLuIQIDAQAB" } } } rows { name { value: "hasSignature" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "nlQVR7h6putZiPWhdSKvWTbKQxNUYXYqD3Nu931hv28ziAo2Vko+rCA8JcSzAvjZ2pA5hlcy5h//+8zKr1+hPlMQVBqxa2QeeJJ7xhAPSrwZOG8aGw9ToT46cQFcT+CvFPW8StzFrQx4jJhtdTenMmtj6UUU9xZ1hxbLvrSjeFErEf2GWeT0rFzwVM2CEvvafP3w57pLd9cdxrrgXIeg2cgDn85ajm1yxbFRq/oRJvvG2p1MJVc3h2otd7A/LrY5F694sgv7cZ9behfeiWKJjblUbtq+9c3RoCKVtfwkNxfkdGGDu/Mf67HGvG+v2OhrY9BnPEC48Bn6Nr6jdZAXZA==" } } } rows { name { value: "hasSignatureTarget" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 1 name_id: 1 } } }